Az anim�nek rengeteg m�faja l�tezik, ahogy a hagyom�nyos, �l�szerepl�s mozinak is. Kaland, sci-fi, gyerekmes�k, romantika, k�z�pkori fantasy, er�sen pornogr�f (hentai), okkult/horror, akci� �s dr�ma, a teljess�g ig�nye n�lk�l.

A legt�bb anime �tmenetet k�pez t�bb m�faj k�z�tt, �s t�bbfajta mot�vumot tartalmaz. �gy az egyes filmek kateg�ri�kba szor�t�sa neh�zs�gekbe �tk�zhet. El�fordul, hogy egy anim�nek l�tsz�lag egyszer� t�rt�nete van a felsz�nen, de ezzel egyid�ben l�tezik egy bonyolultabb, m�lyebb cselekm�ny �s karakterfejl�d�s. Szok�sos, hogy egy akci�d�s anime humoros, romantikus vagy ak�r sz�vbe markol� elemeket is mag�ban foglal. Ugyan�gy el�fordulhatnak egy els�sorban romantikus anim�ben er�s akci�jelenetek.

Anime- �s manga-specifikus m�fajok:

• Bishōjo: jap�nul 'gy�ny�r� l�ny', olyan anim�k �sszefoglal� neve, amikben csinos l�nyok szerepelnek, p�ld�ul a Magic Knight Rayearth
• Bishōnen: jap�nul 'gy�ny�r� fi�' olyan anim�k �sszefoglal� neve, amikben sz�p �s eleg�ns fi�k vagy f�rfiak szerepelnek, p�ld�ul a Fushigi Yugi
• Ecchi: jap�nul 'illetlen szexualit�s'. K�nny� szexu�lis humort tartalmaz, p�ld�ul a Love Hina.
• Hentai: jap�nul 'abnorm�lis' vagy 'perverz', �ltal�ban nyugaton pornografikus vagy erotikus anim�t �rtik alatta. Jap�nban ezeket Poruno vagy Ero c�men keresik.
• Josei: jap�nul 'fiatal n�', olyan anime vagy manga aminek fiatal n�k k�pezik a c�lk�z�ns�g�t, ez az egyik legritk�bb m�faj.
• Kodomo: jap�nul 'gyerek', kisgyermekek sz�m�ra k�sz�lt anime vagy manga, ilyen p�ld�ul a Doraemon.
• Mecha: �ri�s robotokat felvonultat� anime vagy manga, mint p�ld�ul a Mobile Suit Gundam.
• Mo�: olyan anime vagy manga amiben nagyon pajkosak vagy cukik a szerepl�k, ilyen p�ld�ul a Little Snow Fairy Sugar.
• progressz�v: „m�v�szfilmek”, vagy nagyon stiliz�lt anim�k, p�ld�ul a Voices of a Distant Star.
• Seinen: a Shōnenhez hasonl�t, de tin�dzserek vagy fiatal f�rfiak sz�m�ra k�sz�l, p�ld�ul az Oh My Goddess!.
• Sentai/Super Sentai: sz� szerint „harci alakulat”, ezekben szuperh�s-csapatok szerepelnek, ilyen p�ld�ul a Cyborg 009.
• Shōjo: jap�nul 'fiatal h�lgy' vagy 'kisl�ny', l�nyok sz�m�ra k�sz�tett anim�k, ilyen p�ld�ul a Fruits Basket.
• Mahō Shōjo: a Shōjo alm�faja 'Magical Girl' t�rt�netekkel, mint pl. a Sailor Moon.
• Shōjo-ai: jap�nul 'l�nyszerelem', olyan anim�re vagy mang�ra utal, amik n�i szerepl�k k�z�tti szerelemre vagy rom�ncra f�kusz�lnak. A shōjo m�faj�ba sorolj�k, mivel legink�bb fiatal l�nyoknak sz�nt anim�kr�l/mang�kr�l van sz�. Ilyen p�ld�ul a Revolutionary Girl Utena.
• Shōnen: jap�nul 'fi�k', azaz fi�k sz�m�ra k�sz�tett anime vagy manga, mint pl. a Dragon Ball Z.
• Shōnen-ai: jap�nul 'fi�szerelem', f�rfi szerepl�k k�z�tti szerelemre vagy rom�ncra f�kusz�l, Jap�nban egyre kev�sb� haszn�lj�k ezt a kifejez�st, mivel a pedof�li�ra utalhat, ez�rt ink�bb a "Boys Love"-ot (BL) haszn�lj�k. Gyakran a shōjo mang�k k�z�s sorolj�k �ket, mivel olvas�ik let�bbsz�r fiatal l�nyok. A st�lus egyik jellemz� k�pvisel�je a Gravitation.
• Yaoi: a shōnen-ai erotikusabb v�ltozata. M�g a shōnen-ai mang�kban maximum cs�kjelenetek vannak, addig a yaoi gyakran tartalmaz r�szletesen megrajzolt szexjeleneteket.
• Yuri: A shōjo-ai erotikusabb form�ja, ugyanaz igaz r�, mint a yaoira �s a shōnen-ai-ra.